تشمل الصحراء الكبرى الإفريقية كل من الصحراء الغربية وموريتانيا والجزائر وليبيا ومصر والأجزاء الجنوبية من المملكة المغربية وتونس والأجزاء الشمالية من السودان وتتفرع إلى ما يلي:
- الصحراء الغربية المصرية والتي تمتد ما بين وادي النيل في الغرب والحدود الليبية.
- الصحراء الشرقية والتي تنحصر ما بين نهر النيل والبحر الأحمر في مصر.
- الصحراء الليبية.
- صحراء النوبة وتشغل شمال شرق السودان.